24 февраля 2014 года судья Наталья Никишина осудила Духанину на 3 года и 3 месяца лишения свободы условно.

6 июня 2013 года начались предварительные слушания по «Делу двенадцати» в рамках Болотного дела. Рассмотрением занимается председатель Замоскворецкого суда Москвы Наталья Никишина. Продление домашнего ареста на 6 месяцев до 24 ноября 2013 года.

23 мая 2013 года защита Духаниной получает обвинительное заключение по «Делу двенадцати», дело выделенное из «большого» Болотного дела. Объем обвинительного заключения составил 2 804 лист.

26 апреля 2013 года Следственный комитет завершил расследование уголовного дела в отношении Александры Духаниной и передал материалы в прокуратуру.

22 апреля 2013 года МосГорСуд продлил арест Зимину до 6 июля 2013 года. Основание для продления — Кривов и Савелов не ознакомились с материалами дела.

5 марта 2013 года в Басманном суде судья Карпов изучил документы по делу, характеристики из ДЭЗа, школы, психоневрологического диспансера, и после перерыва удовлетворил ходатайство следствия, продлив домашний арест до 27 мая 2013 года.

30 ноября 2012 года защита Духаниной получила уведомление от следствия об окончании следственных действий. Потерпевшие начали ознакомление с материалами дела.

6 ноября 2012 года старший следователь по особо важным делам Р. Р. Габдулин постановил привлечь Духанину Александру в качестве обвиняемого по данному уголовному делу, предъявив ей обвинение (в окончательной редакции) в совершении преступлений, предусмотренных ч. 2 ст. 212, ч. 1 ст. 318 УК РФ.

1 ноября 2012 года судья Басманного суда Скуридина удовлетворила запрос следствия и продлила срок содержания Александры под стражей до 6 марта 2013 года.

13 августа 2012 года прошли следственные действия — очная ставка с пострадавшим ОМОНовцем. на которой было официально установлено, что последнему не были причинены какие-либо телесные повреждения, и он не испытывал боли от попадания камнем.

2 июля 2012 года судья Басманного суда Карпов удовлетворил ходатайство следствия, продлив пребывание Духаниной под домашним арестом еще на четыре месяца — до 6 ноября.

4 июня 2012 года было выдвинуто обвинение — ей вменили участие в массовых беспорядках (ч. 2 ст. 212 УК РФ) и насилие по отношению к представителю власти (ч. 1 ст. 318 УК РФ). В обвинении указано, что она якобы применила физическое насилие в отношении 2х установленных сотрудников полиции, прицельно забрасывая их камнями и бутылками.

29 мая 2012 года судья Басманного суда Н. Дударь определила Духаниной меру пресечения в виде домашнего ареста на срок до 6 июля. Духанина оказалась единственной, кому применили не самую строгую меру пресечения, поэтому защита не стала обжаловать решение суда.

27 мая 2012 года Духанина была задержана сотрудниками полиции в штатском в лагере «ОккупайАрбат».

6 мая 2012 года была задержана на Болотной площади и доставлена в ОВД «Раменки».